Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALSU1Q96EH3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms