Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMBR1LQ6UX01 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMBR1LQ6UX01 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMBR1LQ6UX01 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMBR1LQ6UX01 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMBR1LQ6UX01 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMBR1LQ6UX01 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMBR1LQ6UX01 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMBR1LQ6UX01 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMBR1LQ6UX01 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMBR1LQ6UX01 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMBR1LQ6UX01 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMBR1LQ6UX01 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LMBR1LQ6UX01 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMBR1LQ6UX01 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMBR1LQ6UX01 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMBR1LQ6UX01 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms