Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTR9Q6PD62 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.8 ms