Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC178Q5BJE1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC178Q5BJE1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms