Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNN3Q15417 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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