Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTF1Q15361 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTF1Q15361 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTF1Q15361 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TTF1Q15361 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TTF1Q15361 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTF1Q15361 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TTF1Q15361 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTF1Q15361 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTF1Q15361 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTF1Q15361 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTF1Q15361 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTF1Q15361 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTF1Q15361 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTF1Q15361 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTF1Q15361 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TTF1Q15361 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTF1Q15361 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
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