Protein–RNA interactions for Protein: Q12697

YPK9, Vacuolar cation-transporting ATPase YPK9, yeastyeast

Predictions only

Length 1,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPK9Q12697 CCE1YKL011C 1062 nt0.54□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 LYS14YDR034C 2373 nt0.53□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 CSE1YGL238W 2883 nt0.53□□□□□ -2.32
YPK9Q12697 YER147C-AYER147C-A 411 nt0.53□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 PGA1YNL158W 597 nt0.53□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 UFE1YOR075W 1041 nt0.53□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 YJR029WYJR029W 5268 nt0.53□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.53□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 YCR043CYCR043C 384 nt0.52□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 TSA2YDR453C 591 nt0.52□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 YAL064WYAL064W 285 nt0.52□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 NEJ1YLR265C 1029 nt0.52□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 HHT1YBR010W 411 nt0.52□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 ICS2YBR157C 768 nt0.52□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 MUD2YKL074C 1584 nt0.52□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt0.51□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 RUF20RUF20 443 nt0.51□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 YOR376WYOR376W 369 nt0.51□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 POP6YGR030C 477 nt0.5□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 YMR178WYMR178W 825 nt0.5□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 YBR051WYBR051W 351 nt0.5□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 RIM20YOR275C 1986 nt0.5□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 YDR262WYDR262W 819 nt0.49□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 SLD5YDR489W 885 nt0.49□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 LSM4YER112W 564 nt0.49□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 GDS1YOR355W 1569 nt0.49□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 PFS1YHR185C 714 nt0.48□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 HYM1YKL189W 1200 nt0.48□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 YNL010WYNL010W 726 nt0.48□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 YOL150CYOL150C 312 nt0.48□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 IRC23YOR044W 474 nt0.48□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.48□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 BEM3YPL115C 3387 nt0.48□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 KAR9YPL269W 1935 nt0.48□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 IES5YER092W 378 nt0.48□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 NUT1YGL151W 3399 nt0.47□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 MIC19YFR011C 513 nt0.47□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 YLL020CYLL020C 306 nt0.47□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 COX8YLR395C 237 nt0.47□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 SLX4YLR135W 2247 nt0.47□□□□□ -2.33
YPK9Q12697 BTN2YGR142W 1233 nt0.46□□□□□ -2.34
YPK9Q12697 YIR020CYIR020C 303 nt0.46□□□□□ -2.34
YPK9Q12697 YJR071WYJR071W 369 nt0.46□□□□□ -2.34
YPK9Q12697 snR24snR24 89 nt0.46□□□□□ -2.34
YPK9Q12697 AIM9YER080W 1884 nt0.45□□□□□ -2.34
YPK9Q12697 YCR016WYCR016W 873 nt0.45□□□□□ -2.34
YPK9Q12697 SAY1YGR263C 1275 nt0.45□□□□□ -2.34
YPK9Q12697 SMD2YLR275W 333 nt0.45□□□□□ -2.34
YPK9Q12697 CGI121YML036W 546 nt0.45□□□□□ -2.34
YPK9Q12697 YNL171CYNL171C 369 nt0.45□□□□□ -2.34
YPK9Q12697 YBR062CYBR062C 543 nt0.45□□□□□ -2.34
YPK9Q12697 RRP15YPR143W 753 nt0.45□□□□□ -2.34
YPK9Q12697 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt0.45□□□□□ -2.34
YPK9Q12697 SLY1YDR189W 2001 nt0.44□□□□□ -2.34
YPK9Q12697 RPC25YKL144C 639 nt0.44□□□□□ -2.34
YPK9Q12697 SGD1YLR336C 2700 nt0.44□□□□□ -2.34
YPK9Q12697 ESP1YGR098C 4893 nt0.44□□□□□ -2.34
YPK9Q12697 MMS21YEL019C 804 nt0.43□□□□□ -2.34
YPK9Q12697 YGL217CYGL217C 342 nt0.43□□□□□ -2.34
YPK9Q12697 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt0.43□□□□□ -2.34
YPK9Q12697 LAG1YHL003C 1236 nt0.43□□□□□ -2.34
YPK9Q12697 NDD1YOR372C 1665 nt0.43□□□□□ -2.34
YPK9Q12697 SWT1YOR166C 1377 nt0.42□□□□□ -2.34
YPK9Q12697 GEP7YGL057C 864 nt0.42□□□□□ -2.34
YPK9Q12697 ROX1YPR065W 1107 nt0.42□□□□□ -2.34
YPK9Q12697 YBR224WYBR224W 516 nt0.42□□□□□ -2.34
YPK9Q12697 SGO1YOR073W 1773 nt0.42□□□□□ -2.34
YPK9Q12697 OSH6YKR003W 1347 nt0.42□□□□□ -2.34
YPK9Q12697 SMB1YER029C 591 nt0.41□□□□□ -2.34
YPK9Q12697 SWS2YNL081C 432 nt0.41□□□□□ -2.34
YPK9Q12697 YOL024WYOL024W 519 nt0.41□□□□□ -2.34
YPK9Q12697 HOT13YKL084W 351 nt0.41□□□□□ -2.34
YPK9Q12697 SLS1YLR139C 1932 nt0.4□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 RSM28YDR494W 1086 nt0.4□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 VMA7YGR020C 357 nt0.4□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 YLR031WYLR031W 561 nt0.4□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 RPL38YLR325C 237 nt0.4□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 FMP23YBR047W 528 nt0.4□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 GPX2YBR244W 489 nt0.4□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 PEX34YCL056C 435 nt0.4□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 SPT21YMR179W 2277 nt0.4□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 YDR248CYDR248C 582 nt0.39□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 YGR045CYGR045C 363 nt0.39□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 IST3YIR005W 447 nt0.39□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 SEC22YLR268W 645 nt0.39□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 YOL118CYOL118C 309 nt0.39□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 ATP15YPL271W 189 nt0.39□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 NOT5YPR072W 1683 nt0.39□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 BI3Q0115 1554 nt0.38□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 PRM8YGL053W 714 nt0.38□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 RCN1YKL159C 636 nt0.37□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 GSP1YLR293C 660 nt0.37□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 PET20YPL159C 762 nt0.37□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 RTC6YPL183W-A 282 nt0.37□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 YDL009CYDL009C 324 nt0.36□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 SLU7YDR088C 1149 nt0.36□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 YEL010WYEL010W 351 nt0.36□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 CYC7YEL039C 342 nt0.36□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 MXR1YER042W 555 nt0.36□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt0.36□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 65.6 ms