Protein–RNA interactions for Protein: Q12141

TY1B-GR1, Transposon Ty1-GR1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR1Q12141 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-GR1Q12141 VPS25YJR102C 609 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-GR1Q12141 HSK3YKL138C-A 210 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-GR1Q12141 TAP42YMR028W 1101 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-GR1Q12141 RTR1YER139C 681 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-GR1Q12141 YER147C-AYER147C-A 411 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-GR1Q12141 YHR212CYHR212C 336 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-GR1Q12141 RPS24BYIL069C 408 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-GR1Q12141 YAR060CYAR060C 336 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-GR1Q12141 YML047W-AYML047W-A 366 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-GR1Q12141 RPL9BYNL067W 576 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-GR1Q12141 AIM41YOR215C 558 nt0.13□□□□□ -2.39
TY1B-GR1Q12141 TRS20YBR254C 528 nt0.13□□□□□ -2.39
TY1B-GR1Q12141 TMA20YER007C-A 546 nt0.12□□□□□ -2.39
TY1B-GR1Q12141 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt0.12□□□□□ -2.39
TY1B-GR1Q12141 YLL020CYLL020C 306 nt0.12□□□□□ -2.39
TY1B-GR1Q12141 ABF2YMR072W 552 nt0.12□□□□□ -2.39
TY1B-GR1Q12141 PEX34YCL056C 435 nt0.12□□□□□ -2.39
TY1B-GR1Q12141 OSH6YKR003W 1347 nt0.12□□□□□ -2.39
TY1B-GR1Q12141 IRC19YLL033W 693 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1B-GR1Q12141 SLS1YLR139C 1932 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1B-GR1Q12141 ULI1YFR026C 510 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1B-GR1Q12141 COG7YGL005C 840 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1B-GR1Q12141 SDL1YIL167W 633 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1B-GR1Q12141 HDA3YPR179C 1968 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1B-GR1Q12141 MUD2YKL074C 1584 nt0.1□□□□□ -2.39
TY1B-GR1Q12141 SGD1YLR336C 2700 nt0.1□□□□□ -2.39
TY1B-GR1Q12141 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.1□□□□□ -2.39
TY1B-GR1Q12141 YBR012CYBR012C 420 nt0.1□□□□□ -2.39
TY1B-GR1Q12141 YOR282WYOR282W 321 nt0.1□□□□□ -2.39
TY1B-GR1Q12141 UTP10YJL109C 5310 nt0.1□□□□□ -2.39
TY1B-GR1Q12141 YCR043CYCR043C 384 nt0.09□□□□□ -2.39
TY1B-GR1Q12141 GIC2YDR309C 1152 nt0.09□□□□□ -2.39
TY1B-GR1Q12141 NDD1YOR372C 1665 nt0.09□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt0.09□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 DUO1YGL061C 744 nt0.09□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 RSM27YGR215W 333 nt0.09□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 BMT5YIL096C 1011 nt0.09□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 YAL069WYAL069W 315 nt0.09□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 ATX1YNL259C 222 nt0.09□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 IZH4YOL101C 939 nt0.09□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt0.09□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 NUT2YPR168W 474 nt0.09□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 GLG1YKR058W 1851 nt0.08□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 TOF2YKR010C 2316 nt0.08□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 SWF1YDR126W 1011 nt0.08□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 NNF2YGR089W 2811 nt0.08□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 YJL049WYJL049W 1353 nt0.07□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 RPC25YKL144C 639 nt0.07□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt0.07□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 YDR509WYDR509W 348 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 GRX8YLR364W 330 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 YMR324CYMR324C 243 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 PGA1YNL158W 597 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 RCN1YKL159C 636 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 YLR042CYLR042C 486 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 CGI121YML036W 546 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 YOL150CYOL150C 312 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 GPX2YBR244W 489 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 AFR1YDR085C 1863 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 MPT5YGL178W 2580 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 YDL206WYDL206W 2289 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 YOL050CYOL050C 321 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 LOA1YPR139C 903 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 CYC7YEL039C 342 nt0.03□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 YLR225CYLR225C 1224 nt0.03□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 YPL034WYPL034W 498 nt0.03□□□□□ -2.4
TY1B-GR1Q12141 VIK1YPL253C 1944 nt0.02□□□□□ -2.41
TY1B-GR1Q12141 SLI15YBR156C 2097 nt0.02□□□□□ -2.41
TY1B-GR1Q12141 MRPL24YMR193W 777 nt0.02□□□□□ -2.41
TY1B-GR1Q12141 YNR021WYNR021W 1215 nt0.02□□□□□ -2.41
TY1B-GR1Q12141 PIG1YLR273C 1947 nt0.02□□□□□ -2.41
TY1B-GR1Q12141 VAB2YEL005C 849 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-GR1Q12141 YLR311CYLR311C 348 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-GR1Q12141 SEC5YDR166C 2916 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-GR1Q12141 MKT1YNL085W 2493 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-GR1Q12141 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-GR1Q12141 YJR071WYJR071W 369 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-GR1Q12141 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0□□□□□ -2.41
TY1B-GR1Q12141 NUR1YDL089W 1455 nt0□□□□□ -2.41
TY1B-GR1Q12141 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt0□□□□□ -2.41
TY1B-GR1Q12141 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0□□□□□ -2.41
TY1B-GR1Q12141 SLM6YBR266C 453 nt0□□□□□ -2.41
TY1B-GR1Q12141 HYM1YKL189W 1200 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-GR1Q12141 POP8YBL018C 402 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-GR1Q12141 YOL024WYOL024W 519 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-GR1Q12141 YER046W-AYER046W-A 330 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-GR1Q12141 ISD11YER048W-A 285 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-GR1Q12141 NBP1YLR457C 960 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-GR1Q12141 RPL32YBL092W 393 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-GR1Q12141 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-GR1Q12141 DBP6YNR038W 1890 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-GR1Q12141 IMP3YHR148W 552 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY1B-GR1Q12141 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY1B-GR1Q12141 AEP1YMR064W 1557 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY1B-GR1Q12141 ARP9YMR033W 1404 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY1B-GR1Q12141 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY1B-GR1Q12141 SLD5YDR489W 885 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY1B-GR1Q12141 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt-0.04□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.5 ms