Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms