Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TOP2BQ02880 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms