Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XBP1P17861 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XBP1P17861 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XBP1P17861 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
XBP1P17861 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XBP1P17861 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XBP1P17861 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XBP1P17861 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XBP1P17861 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XBP1P17861 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XBP1P17861 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XBP1P17861 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XBP1P17861 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XBP1P17861 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XBP1P17861 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XBP1P17861 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XBP1P17861 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XBP1P17861 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XBP1P17861 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XBP1P17861 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XBP1P17861 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XBP1P17861 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XBP1P17861 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
XBP1P17861 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XBP1P17861 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XBP1P17861 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
XBP1P17861 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XBP1P17861 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XBP1P17861 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XBP1P17861 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XBP1P17861 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XBP1P17861 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XBP1P17861 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XBP1P17861 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XBP1P17861 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XBP1P17861 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XBP1P17861 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XBP1P17861 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XBP1P17861 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
XBP1P17861 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XBP1P17861 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XBP1P17861 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XBP1P17861 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XBP1P17861 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XBP1P17861 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XBP1P17861 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XBP1P17861 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XBP1P17861 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XBP1P17861 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XBP1P17861 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
XBP1P17861 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
XBP1P17861 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
XBP1P17861 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
XBP1P17861 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
XBP1P17861 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
XBP1P17861 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
XBP1P17861 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XBP1P17861 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XBP1P17861 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XBP1P17861 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
XBP1P17861 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
XBP1P17861 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XBP1P17861 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XBP1P17861 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
XBP1P17861 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XBP1P17861 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
XBP1P17861 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XBP1P17861 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XBP1P17861 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XBP1P17861 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XBP1P17861 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XBP1P17861 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XBP1P17861 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XBP1P17861 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XBP1P17861 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XBP1P17861 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XBP1P17861 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XBP1P17861 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XBP1P17861 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XBP1P17861 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XBP1P17861 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XBP1P17861 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XBP1P17861 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XBP1P17861 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XBP1P17861 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XBP1P17861 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XBP1P17861 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XBP1P17861 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XBP1P17861 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XBP1P17861 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XBP1P17861 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XBP1P17861 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XBP1P17861 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XBP1P17861 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XBP1P17861 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XBP1P17861 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XBP1P17861 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XBP1P17861 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
XBP1P17861 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XBP1P17861 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms