Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn20O55082 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms