Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEURL1BA8MQ27 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEURL1BA8MQ27 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms