Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC4A4Q9Y6R1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A4Q9Y6R1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms