Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms