Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SALL1Q9NSC2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms