Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Wdr61Q9ERF3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Wdr61Q9ERF3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms