Protein–RNA interactions for Protein: Q38HM4

Trim63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim63Q38HM4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim63Q38HM4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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