Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 HOP2YGL033W 657 nt0.39□□□□□ -2.35
TY1B-BRQ12193 SFM1YOR021C 642 nt0.39□□□□□ -2.35
TY1B-BRQ12193 DAS1YJL149W 1992 nt0.38□□□□□ -2.35
TY1B-BRQ12193 AI3Q0060 1248 nt0.38□□□□□ -2.35
TY1B-BRQ12193 PRM8YGL053W 714 nt0.37□□□□□ -2.35
TY1B-BRQ12193 FMP23YBR047W 528 nt0.37□□□□□ -2.35
TY1B-BRQ12193 NUT1YGL151W 3399 nt0.37□□□□□ -2.35
TY1B-BRQ12193 EDC1YGL222C 528 nt0.36□□□□□ -2.35
TY1B-BRQ12193 RPI1YIL119C 1224 nt0.36□□□□□ -2.35
TY1B-BRQ12193 FYV6YNL133C 522 nt0.36□□□□□ -2.35
TY1B-BRQ12193 IRC14YOR135C 342 nt0.36□□□□□ -2.35
TY1B-BRQ12193 ICS2YBR157C 768 nt0.36□□□□□ -2.35
TY1B-BRQ12193 SMY1YKL079W 1971 nt0.36□□□□□ -2.35
TY1B-BRQ12193 AIM9YER080W 1884 nt0.36□□□□□ -2.35
TY1B-BRQ12193 STB6YKL072W 2301 nt0.35□□□□□ -2.35
TY1B-BRQ12193 AHC2YCR082W 387 nt0.35□□□□□ -2.35
TY1B-BRQ12193 SLU7YDR088C 1149 nt0.35□□□□□ -2.35
TY1B-BRQ12193 MFA1YDR461W 111 nt0.35□□□□□ -2.35
TY1B-BRQ12193 SMB1YER029C 591 nt0.35□□□□□ -2.35
TY1B-BRQ12193 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt0.35□□□□□ -2.35
TY1B-BRQ12193 NOP10YHR072W-A 177 nt0.35□□□□□ -2.35
TY1B-BRQ12193 SEC22YLR268W 645 nt0.35□□□□□ -2.35
TY1B-BRQ12193 NUP188YML103C 4968 nt0.35□□□□□ -2.35
TY1B-BRQ12193 URB1YKL014C 5295 nt0.35□□□□□ -2.35
TY1B-BRQ12193 YDR248CYDR248C 582 nt0.34□□□□□ -2.35
TY1B-BRQ12193 RRT16YNL105W 429 nt0.34□□□□□ -2.35
TY1B-BRQ12193 MIX23YBL107C 591 nt0.34□□□□□ -2.35
TY1B-BRQ12193 MSC6YOR354C 2079 nt0.34□□□□□ -2.35
TY1B-BRQ12193 YIL141WYIL141W 390 nt0.34□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 RPL40BYKR094C 387 nt0.34□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 AIM41YOR215C 558 nt0.34□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 ECM12YHR021W-A 456 nt0.33□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt0.33□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 TEX1YNL253W 1269 nt0.33□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 FUS2YMR232W 2034 nt0.33□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 NOP12YOL041C 1380 nt0.33□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 SLY1YDR189W 2001 nt0.33□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 YDL157CYDL157C 357 nt0.32□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 SAY1YGR263C 1275 nt0.32□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 COF1YLL050C 432 nt0.32□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 BFA1YJR053W 1725 nt0.32□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt0.32□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 SST2YLR452C 2097 nt0.32□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 ECM25YJL201W 1800 nt0.32□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 MEI4YER044C-A 1227 nt0.32□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 MVB12YGR206W 306 nt0.32□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 SWS2YNL081C 432 nt0.32□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 YGL109WYGL109W 324 nt0.31□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 RAD10YML095C 633 nt0.31□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 YNL226WYNL226W 411 nt0.31□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 YOR376WYOR376W 369 nt0.31□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 NGG1YDR176W 2109 nt0.31□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 RPL35BYDL136W 363 nt0.3□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 FAR7YFR008W 666 nt0.3□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 GIC1YHR061C 945 nt0.3□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 YLR458WYLR458W 381 nt0.3□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 YML047W-AYML047W-A 366 nt0.3□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 YPR014CYPR014C 330 nt0.3□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 AME1YBR211C 975 nt0.3□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 SLX4YLR135W 2247 nt0.3□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 YCR090CYCR090C 549 nt0.29□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt0.29□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 YPD1YDL235C 504 nt0.29□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 YAR053WYAR053W 297 nt0.29□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 YET2YMR040W 483 nt0.29□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 SWT1YOR166C 1377 nt0.29□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 TSA2YDR453C 591 nt0.29□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 YGR045CYGR045C 363 nt0.29□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 TIF11YMR260C 462 nt0.29□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt0.28□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 GDS1YOR355W 1569 nt0.28□□□□□ -2.36
TY1B-BRQ12193 BPH1YCR032W 6504 nt0.28□□□□□ -2.37
TY1B-BRQ12193 LAG1YHL003C 1236 nt0.27□□□□□ -2.37
TY1B-BRQ12193 GRX7YBR014C 612 nt0.27□□□□□ -2.37
TY1B-BRQ12193 YAL069WYAL069W 315 nt0.27□□□□□ -2.37
TY1B-BRQ12193 MRPL24YMR193W 777 nt0.27□□□□□ -2.37
TY1B-BRQ12193 ESP1YGR098C 4893 nt0.26□□□□□ -2.37
TY1B-BRQ12193 YHR212CYHR212C 336 nt0.26□□□□□ -2.37
TY1B-BRQ12193 EMC5YIL027C 426 nt0.26□□□□□ -2.37
TY1B-BRQ12193 YAR060CYAR060C 336 nt0.26□□□□□ -2.37
TY1B-BRQ12193 MZM1YDR493W 372 nt0.25□□□□□ -2.37
TY1B-BRQ12193 COX6YHR051W 447 nt0.25□□□□□ -2.37
TY1B-BRQ12193 IRC23YOR044W 474 nt0.24□□□□□ -2.37
TY1B-BRQ12193 IES4YOR189W 351 nt0.24□□□□□ -2.37
TY1B-BRQ12193 YBR224WYBR224W 516 nt0.24□□□□□ -2.37
TY1B-BRQ12193 RIM20YOR275C 1986 nt0.24□□□□□ -2.37
TY1B-BRQ12193 SGO1YOR073W 1773 nt0.24□□□□□ -2.37
TY1B-BRQ12193 VMA7YGR020C 357 nt0.24□□□□□ -2.37
TY1B-BRQ12193 BRX1YOL077C 876 nt0.24□□□□□ -2.37
TY1B-BRQ12193 HHT1YBR010W 411 nt0.24□□□□□ -2.37
TY1B-BRQ12193 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.24□□□□□ -2.37
TY1B-BRQ12193 TRS20YBR254C 528 nt0.24□□□□□ -2.37
TY1B-BRQ12193 TAP42YMR028W 1101 nt0.23□□□□□ -2.37
TY1B-BRQ12193 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt0.23□□□□□ -2.37
TY1B-BRQ12193 SGD1YLR336C 2700 nt0.23□□□□□ -2.37
TY1B-BRQ12193 HSK3YKL138C-A 210 nt0.22□□□□□ -2.37
TY1B-BRQ12193 ATX1YNL259C 222 nt0.22□□□□□ -2.37
TY1B-BRQ12193 snR13snR13 124 nt0.22□□□□□ -2.37
TY1B-BRQ12193 GIC2YDR309C 1152 nt0.22□□□□□ -2.37
TY1B-BRQ12193 RSM28YDR494W 1086 nt0.22□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 67.8 ms