Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
POLR2FP61218 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms