Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB25P57735 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB25P57735 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB25P57735 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB25P57735 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB25P57735 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB25P57735 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB25P57735 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB25P57735 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB25P57735 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB25P57735 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB25P57735 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB25P57735 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB25P57735 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB25P57735 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB25P57735 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB25P57735 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB25P57735 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB25P57735 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB25P57735 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB25P57735 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB25P57735 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB25P57735 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB25P57735 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB25P57735 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB25P57735 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB25P57735 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB25P57735 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB25P57735 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB25P57735 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB25P57735 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB25P57735 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB25P57735 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB25P57735 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB25P57735 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB25P57735 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB25P57735 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB25P57735 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB25P57735 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB25P57735 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB25P57735 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB25P57735 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB25P57735 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB25P57735 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB25P57735 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB25P57735 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB25P57735 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB25P57735 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB25P57735 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB25P57735 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB25P57735 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB25P57735 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB25P57735 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB25P57735 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB25P57735 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAB25P57735 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAB25P57735 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAB25P57735 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAB25P57735 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAB25P57735 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAB25P57735 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAB25P57735 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAB25P57735 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB25P57735 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB25P57735 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB25P57735 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB25P57735 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB25P57735 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB25P57735 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB25P57735 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB25P57735 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB25P57735 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB25P57735 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB25P57735 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB25P57735 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB25P57735 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB25P57735 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB25P57735 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB25P57735 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB25P57735 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB25P57735 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB25P57735 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB25P57735 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB25P57735 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB25P57735 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB25P57735 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB25P57735 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB25P57735 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB25P57735 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB25P57735 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB25P57735 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB25P57735 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB25P57735 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB25P57735 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB25P57735 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB25P57735 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB25P57735 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB25P57735 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB25P57735 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB25P57735 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms