Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMTNP53814 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMTNP53814 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMTNP53814 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMTNP53814 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMTNP53814 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMTNP53814 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMTNP53814 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMTNP53814 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMTNP53814 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMTNP53814 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMTNP53814 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMTNP53814 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMTNP53814 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMTNP53814 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMTNP53814 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMTNP53814 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMTNP53814 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMTNP53814 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMTNP53814 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMTNP53814 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMTNP53814 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMTNP53814 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMTNP53814 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMTNP53814 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMTNP53814 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMTNP53814 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMTNP53814 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMTNP53814 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMTNP53814 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMTNP53814 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMTNP53814 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMTNP53814 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMTNP53814 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMTNP53814 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMTNP53814 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMTNP53814 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMTNP53814 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMTNP53814 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMTNP53814 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMTNP53814 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMTNP53814 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMTNP53814 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMTNP53814 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMTNP53814 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMTNP53814 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMTNP53814 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMTNP53814 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMTNP53814 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMTNP53814 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMTNP53814 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMTNP53814 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMTNP53814 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMTNP53814 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMTNP53814 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMTNP53814 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMTNP53814 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMTNP53814 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMTNP53814 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMTNP53814 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMTNP53814 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMTNP53814 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMTNP53814 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMTNP53814 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMTNP53814 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMTNP53814 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMTNP53814 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMTNP53814 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMTNP53814 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMTNP53814 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMTNP53814 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMTNP53814 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMTNP53814 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMTNP53814 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMTNP53814 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMTNP53814 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMTNP53814 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMTNP53814 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMTNP53814 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMTNP53814 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMTNP53814 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMTNP53814 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMTNP53814 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMTNP53814 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMTNP53814 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMTNP53814 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMTNP53814 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMTNP53814 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMTNP53814 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMTNP53814 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMTNP53814 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMTNP53814 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMTNP53814 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMTNP53814 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMTNP53814 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMTNP53814 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMTNP53814 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMTNP53814 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMTNP53814 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMTNP53814 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms