Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD58P19256 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD58P19256 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD58P19256 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD58P19256 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD58P19256 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD58P19256 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD58P19256 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD58P19256 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD58P19256 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD58P19256 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD58P19256 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD58P19256 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD58P19256 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD58P19256 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD58P19256 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD58P19256 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD58P19256 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD58P19256 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD58P19256 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD58P19256 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD58P19256 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD58P19256 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD58P19256 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD58P19256 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CD58P19256 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD58P19256 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD58P19256 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD58P19256 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CD58P19256 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD58P19256 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD58P19256 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD58P19256 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD58P19256 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD58P19256 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD58P19256 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CD58P19256 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD58P19256 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD58P19256 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD58P19256 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD58P19256 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD58P19256 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD58P19256 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD58P19256 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CD58P19256 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CD58P19256 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CD58P19256 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CD58P19256 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD58P19256 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD58P19256 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD58P19256 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD58P19256 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CD58P19256 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD58P19256 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD58P19256 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD58P19256 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD58P19256 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD58P19256 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD58P19256 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD58P19256 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD58P19256 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD58P19256 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD58P19256 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD58P19256 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD58P19256 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD58P19256 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD58P19256 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD58P19256 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CD58P19256 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD58P19256 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD58P19256 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CD58P19256 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD58P19256 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD58P19256 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD58P19256 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD58P19256 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD58P19256 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD58P19256 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD58P19256 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD58P19256 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CD58P19256 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD58P19256 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD58P19256 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CD58P19256 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD58P19256 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD58P19256 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CD58P19256 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD58P19256 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD58P19256 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CD58P19256 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD58P19256 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD58P19256 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD58P19256 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD58P19256 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD58P19256 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD58P19256 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD58P19256 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD58P19256 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CD58P19256 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD58P19256 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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