Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT3P12035 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT3P12035 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT3P12035 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT3P12035 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT3P12035 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT3P12035 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT3P12035 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT3P12035 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT3P12035 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT3P12035 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT3P12035 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT3P12035 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT3P12035 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT3P12035 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT3P12035 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT3P12035 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT3P12035 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT3P12035 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT3P12035 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT3P12035 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT3P12035 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT3P12035 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT3P12035 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT3P12035 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT3P12035 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT3P12035 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT3P12035 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT3P12035 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT3P12035 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT3P12035 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT3P12035 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT3P12035 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT3P12035 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT3P12035 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT3P12035 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT3P12035 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT3P12035 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT3P12035 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT3P12035 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT3P12035 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT3P12035 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT3P12035 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT3P12035 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT3P12035 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT3P12035 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT3P12035 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT3P12035 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT3P12035 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT3P12035 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT3P12035 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT3P12035 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT3P12035 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT3P12035 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT3P12035 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT3P12035 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT3P12035 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT3P12035 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT3P12035 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT3P12035 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT3P12035 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT3P12035 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT3P12035 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT3P12035 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT3P12035 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT3P12035 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT3P12035 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT3P12035 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT3P12035 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT3P12035 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT3P12035 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT3P12035 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT3P12035 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT3P12035 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT3P12035 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT3P12035 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT3P12035 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT3P12035 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT3P12035 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT3P12035 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT3P12035 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT3P12035 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT3P12035 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT3P12035 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT3P12035 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT3P12035 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT3P12035 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT3P12035 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT3P12035 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT3P12035 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT3P12035 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT3P12035 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT3P12035 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT3P12035 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT3P12035 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT3P12035 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT3P12035 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT3P12035 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT3P12035 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT3P12035 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms