Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMIGD3P0DMS9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms