Protein–RNA interactions for Protein: P01193

Pomc, Pro-opiomelanocortin, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PomcP01193 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PomcP01193 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PomcP01193 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PomcP01193 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PomcP01193 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PomcP01193 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PomcP01193 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PomcP01193 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PomcP01193 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PomcP01193 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PomcP01193 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PomcP01193 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PomcP01193 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PomcP01193 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PomcP01193 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PomcP01193 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PomcP01193 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PomcP01193 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PomcP01193 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PomcP01193 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PomcP01193 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PomcP01193 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PomcP01193 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PomcP01193 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PomcP01193 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PomcP01193 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PomcP01193 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PomcP01193 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PomcP01193 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PomcP01193 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PomcP01193 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PomcP01193 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PomcP01193 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PomcP01193 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PomcP01193 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PomcP01193 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PomcP01193 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PomcP01193 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PomcP01193 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PomcP01193 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PomcP01193 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PomcP01193 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PomcP01193 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PomcP01193 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PomcP01193 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PomcP01193 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PomcP01193 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PomcP01193 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PomcP01193 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PomcP01193 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PomcP01193 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PomcP01193 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PomcP01193 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PomcP01193 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PomcP01193 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PomcP01193 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PomcP01193 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PomcP01193 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PomcP01193 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PomcP01193 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PomcP01193 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PomcP01193 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PomcP01193 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PomcP01193 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PomcP01193 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PomcP01193 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PomcP01193 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PomcP01193 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PomcP01193 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PomcP01193 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PomcP01193 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PomcP01193 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PomcP01193 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PomcP01193 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PomcP01193 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PomcP01193 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PomcP01193 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PomcP01193 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PomcP01193 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PomcP01193 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PomcP01193 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PomcP01193 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PomcP01193 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PomcP01193 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PomcP01193 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PomcP01193 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PomcP01193 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PomcP01193 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PomcP01193 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PomcP01193 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PomcP01193 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PomcP01193 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PomcP01193 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PomcP01193 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PomcP01193 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PomcP01193 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PomcP01193 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PomcP01193 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PomcP01193 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PomcP01193 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms