Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms