Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC144AA2RUR9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC144AA2RUR9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC144AA2RUR9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC144AA2RUR9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC144AA2RUR9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC144AA2RUR9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC144AA2RUR9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC144AA2RUR9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC144AA2RUR9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms