Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm21070-201ENSMUST00000182425 985 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm21856-201ENSMUST00000187547 696 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm29196-201ENSMUST00000189239 618 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm8319-201ENSMUST00000205708 641 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Vmn1r32-201ENSMUST00000079584 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps2-201ENSMUST00000121053 765 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm22395-201ENSMUST00000177427 96 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 AC168881.1-201ENSMUST00000226018 430 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Muc15-202ENSMUST00000111016 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Ddx60-202ENSMUST00000093485 5989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm15517-201ENSMUST00000124863 251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm4707-202ENSMUST00000183937 276 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 AC157515.1-201ENSMUST00000220953 450 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Olfr1444-201ENSMUST00000059675 1129 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Olfr819-202ENSMUST00000216322 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms