Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A3BPQ9Y5P4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A3BPQ9Y5P4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms