Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms