Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCP2D1Q9UJQ7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms