Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CNNM1Q9NRU3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNNM1Q9NRU3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNNM1Q9NRU3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNNM1Q9NRU3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNNM1Q9NRU3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNNM1Q9NRU3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNNM1Q9NRU3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNNM1Q9NRU3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNNM1Q9NRU3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNNM1Q9NRU3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNNM1Q9NRU3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms