Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cul3Q9JLV5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms