Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s1Q9DCR2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms