Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D7E4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D7E4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D7E4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D7E4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9D7E4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D7E4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D7E4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q9D7E4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms