Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NLRP1Q9C000 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NLRP1Q9C000 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms