Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVT8

TMUB1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB1Q9BVT8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMUB1Q9BVT8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMUB1Q9BVT8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMUB1Q9BVT8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMUB1Q9BVT8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMUB1Q9BVT8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMUB1Q9BVT8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMUB1Q9BVT8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMUB1Q9BVT8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMUB1Q9BVT8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMUB1Q9BVT8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMUB1Q9BVT8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMUB1Q9BVT8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMUB1Q9BVT8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMUB1Q9BVT8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMUB1Q9BVT8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TMUB1Q9BVT8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMUB1Q9BVT8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMUB1Q9BVT8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMUB1Q9BVT8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMUB1Q9BVT8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMUB1Q9BVT8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMUB1Q9BVT8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMUB1Q9BVT8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMUB1Q9BVT8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms