Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIOK1Q9BRS2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms