Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK5RAP3Q96JB5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms