Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4CQ96DT6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms