Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Hoxc12Q8K5B8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Hoxc12Q8K5B8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Hoxc12Q8K5B8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Hoxc12Q8K5B8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxc12Q8K5B8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxc12Q8K5B8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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