Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vipas39Q8BGQ1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Vipas39Q8BGQ1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Vipas39Q8BGQ1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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