Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms