Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chsy3Q5DTK1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Chsy3Q5DTK1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Chsy3Q5DTK1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Chsy3Q5DTK1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chsy3Q5DTK1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chsy3Q5DTK1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chsy3Q5DTK1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chsy3Q5DTK1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chsy3Q5DTK1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chsy3Q5DTK1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chsy3Q5DTK1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chsy3Q5DTK1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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