Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDCA8Q53HL2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms