Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SBK1Q52WX2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SBK1Q52WX2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms