Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC27Q2M243 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC27Q2M243 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms