Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
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