Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMF1P82094 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMF1P82094 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TMF1P82094 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMF1P82094 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMF1P82094 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMF1P82094 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMF1P82094 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMF1P82094 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TMF1P82094 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMF1P82094 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMF1P82094 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMF1P82094 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMF1P82094 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMF1P82094 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMF1P82094 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMF1P82094 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMF1P82094 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMF1P82094 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMF1P82094 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TMF1P82094 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TMF1P82094 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TMF1P82094 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMF1P82094 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMF1P82094 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMF1P82094 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMF1P82094 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMF1P82094 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMF1P82094 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMF1P82094 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMF1P82094 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMF1P82094 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMF1P82094 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TMF1P82094 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TMF1P82094 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMF1P82094 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMF1P82094 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMF1P82094 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TMF1P82094 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMF1P82094 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMF1P82094 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMF1P82094 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMF1P82094 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMF1P82094 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMF1P82094 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMF1P82094 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMF1P82094 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMF1P82094 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMF1P82094 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMF1P82094 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMF1P82094 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMF1P82094 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMF1P82094 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMF1P82094 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMF1P82094 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMF1P82094 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMF1P82094 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMF1P82094 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMF1P82094 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMF1P82094 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMF1P82094 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMF1P82094 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMF1P82094 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMF1P82094 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMF1P82094 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMF1P82094 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMF1P82094 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMF1P82094 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMF1P82094 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMF1P82094 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMF1P82094 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMF1P82094 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMF1P82094 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMF1P82094 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMF1P82094 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMF1P82094 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMF1P82094 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMF1P82094 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TMF1P82094 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMF1P82094 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMF1P82094 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMF1P82094 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMF1P82094 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMF1P82094 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMF1P82094 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMF1P82094 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMF1P82094 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMF1P82094 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMF1P82094 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMF1P82094 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TMF1P82094 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMF1P82094 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMF1P82094 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMF1P82094 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMF1P82094 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMF1P82094 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMF1P82094 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMF1P82094 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMF1P82094 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMF1P82094 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms